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“誰說的?第一對氫鍵賦值根本不影響。你先試試吧?!逼顣F對他說道。
小伙子將信將疑地加上了一段兒if,從另外一個單純使用能量最低原理的算法里復制出了相關代碼。
他再運行之后,輸出的矩陣里果然不全是負數了。
但很明顯結果也不對。
負數還是太多了,導致最大值才只有不到4,而很明顯用于測試的那段30個堿基的線性rna不可能只形成一個堿基配對。
“這又是怎么回事兒?”小伙子這回直接對她問道。
祁旻湊到屏幕前仔細看了看,而后一邊敲著鍵盤一邊說道:“你這個對比最大值的嵌套for語句里沒有加flag,只要加上就好了……”
代碼再運行了一遍,這回輸出的矩陣終于看起來正常了。
小伙子松了口氣兒,剛要從椅子上站起來,祁旻卻說道:“哎,這還是不對。你看這段rna的已知結構,這里面有三個loop,但你的算法算出來有四個……哦,我知道了,還得加一個防止無效配對的if,連續兩個堿基以下的配對不應該存在。”
她把這個if語句加進去之后,最終畫出的rna二級結構終于和已知結構一樣了。
“呃……你還真……”小伙子看著屏幕上的圖像,不自覺地露出了一絲傻笑。
而后他看了一眼祁旻,有些奇怪地問道:“你是新來的?我記得今年我們這兒不招博士生了——你是技術員?”
“沒,我就是來找周曉姍老師有點兒事兒?!逼顣F笑著說道。
“什么事兒?”小伙子問道,而后像是意識到這個問題有點兒侵犯別人隱私,于是補充道,“或許我也能幫你一下兒?!?
“還真沒準兒?!逼顣F從他的屏幕面前移開,“我來找周曉姍老師是為了能用一下兒‘雨云’。”
“哦,那好說啊。”小伙子立刻答應道,“如果我老板不同意,你還能用我的號。”
“這樣還是不太好吧……”祁旻有些尷尬地笑了笑。跑類腦體占用的計算資源可是非常多的,如果是偷偷用某個博士生的號,肯定會引起管理員的懷疑。
“那有什么的?”小伙子無所謂地說,“‘雨云’的計算能力這么強,一般的項目根本不是事兒。老板就是想弄點兒大項目,測試一下兒它的實際計算能力,才召了我們這些個做生物的人來到處接活兒。說實話,我在來這兒之前都沒怎么學過python?!?
看得出來。祁旻在心里默默地評價了一句,而后又開玩笑地問:“那要是周曉姍老師把我拒了,我可就真來借你的號了?”
“行,當然行?!毙』镒恿⒖陶f道,“來加個微信,到時候這個rna算法出bug了,我還得再找你呢?!?